بهینه سازی استخراج dna ژنومی باکتریایی به روش سیلیکاژل
نویسندگان
چکیده
سابقه و هدف:در عصر حاضر، آزمایشات مولکولی گسترش بسیاری پیدا نموده است. اولین گام در موفقیت این آزمایشات استخراج صحیح اسید نوکلئیک می باشد. در این مطالعه، دستور کاری برای استخراج dna براساس سلیکا ارائه گردیده است. خالص سازی dna براساس تکنولوژی غشاء سیلیکاژل یک روش ساده و شامل سه مرحله اتصال، شستشو و بازیابی می باشد. اسیدهای نوکلئیک برخلاف پلی ساکاریدها و پروتئی نها، در حضور نمک های کائوتروپیک ( ciportoahc ) جذب سلیکا می شوند و با شستشو حذف م یگردند. پس از مرحله شستشو، اسیدهای نوکلئیک خالص سازی شده، ب هوسیله شستشو با بافر یا آب مقطر از سیلیکا جدا و بازیابی م یگردند؛ بنابراین هدف از این مطالعه معرفی یک روش استخراج dna با کیفیت بالا و ساده است. مواد و روش ها: در این مطالعه 8 نمونه باکتری شامل 3 باکتری گرم مثبت و 5 باکتری گرم منفی مورد بررسی قرار گرفت. استخراج dna تمام نمونه ها براساس سلیکا محلول انجام گردید. مقدار چگالی نوری( do ) آ نها با استفاده دستگاه بایوفتومتر سنجیده شده و برای تعیین کیفیت هر نمونه پس از استخراج، نمونه ها بر روی ژل آگارز برده شدند. جذب نوری در 280/260 mn به طور میانگین 1/29 بوده و الکتروفورز از محصولات pcr بر روی ژل آگارز 5/ 1 درصد انجام گردید. یافته ها: متوسط جذب dna در 260/280 mn از dna باکتری های گرم منفی و باکتری های گرم مثبت استخراج شده از سلول های خونی، به ترتیب 1 و 25 / 1 بود. براساس نتایج به دست آمده الکتروفورز ژل آگارز از محصولات pcr بهره وری بالایی داشت. نتیجه گیری: نتایج مطالعه حاضر نشان داد که این روش کاری برای باکتری های گرم منفی در مقایسه با باکتری های گرم مثبت بهره وری بیشتری دارد و روش ژل سیلیکا محلول یک روش ساده، ارزان و با کیفیت مناسب می باشد. با این حال این روش معایبی دارد که با تغییر در روش کار مانند: افزایش زمان، دفعات شستشو و تغییر در زمان اثردهی آنزی مها و ... می توان کیفیت آن را افزایش داد.
منابع مشابه
بهینه سازی استخراج DNA ژنومی باکتریایی به روش سیلیکاژل
Background & Objectives: Today, major progress has been made in molecular experiments. The first step towards improving these experiments is the accurate extraction of nucleic acid. In this study, a protocol for DNA extraction was proposed in accordance with silica gel method. DNA purification, developed based on the silica-gel-membrane technology, is a simple method, which involves three s...
متن کاملبهینه سازی روش استخراج DNA در Amygdalus spp
مقاله حاضر به ارائه روشی ساده جهت استخراج DNA ژنومی از گیاهان دارای متابولیتهای ثانویه زیاد می پردازد. در این روش برگهای جوان و برگهای نسبتاً مسن از گونه های مختلف بادام وحشی و نیز ارقام اهلی، به عنوان مواد گیاهی، مورد بررسی قرار گرفتند. دراین روش ازSDS به جای CTAB که عمدتاً برای استخراج DNAگیاهان حاوی پلی ساکارید زیاد بکارمیرود و نیز سارکوسیل که دارای هزینه نسبتاً بالایی می باشند، نمک NaCI با غلظ...
متن کاملبه کارگیری 3 روش متفاوت استخراج DNA برای آنالیز بقایای ژنومی DNA در روغن خام و تصفیه شده سویا
زمینه مطالعه: روغن سویا یکی از پرمصرف ترین روغن‌های گیاهی در جهان است. این روزها، استفاده از دانه‌های سویا اصلاح ژنتیکی شده برای تولید روغن سویا به طور مداوم در حال افزایش می‌باشد. روش مناسب برای تشخیص گیاهان اصلاح ژنتیکی شده در روغن و غذا با میزان بالا فرآوری، روشی است که بر پایه آنالیز بقایای ژنتیکی موجود در غذا باشد. کارایی و تکثیر موفق DNA استخراج شده، شدیداً به روش مورد استفاده برای استخراج...
متن کاملاستخراج DNA از ریشه مو با روش نمکی بهینه یافته
The reliability and performance of the molecular diagnostic assays such as polymerase chain reaction (PCR), enzyme digestion and other applications are influence by quantity and quality of the extracted DNA strongly. Furthermore, to choose suitable and optimal tissue for genomic experiments nevertheless consider quantity and quality of the extracted DNA, we need to consider the comfort of sampl...
متن کاملمعرفی روش ساده و آسان برای استخراج DNA ژنومی در قارچهای رشتهای
امروزه روشهای مولکولی لازمه انجام بسیاری از تحقیقات می‌باشد. اساس کار اکثر این آزمایشات و تحقیقات مولکولی بر پایه استخراج DNA می‌باشد، از این رو انتخاب و کشف روش جدیدی که در عین نتیجه بخش بودن، کم هزینه، ساده، کم خطر و سریع نیز باشد بسیار حائز اهمیت است. تکنیک‌های معمولی که در بخش کشاورزی جهت استخراج DNA قارچهای رشتهای مورد استفاده قرار می‌گیرد شامل C-TAB، فنل کلروفرم و کیتهای آزمایشگاهی اس...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
عنوان ژورنال:
مجله طب پیشگیری طبریجلد ۲، شماره ۱، صفحات ۳۱-۳۷
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023